Détection des pathogènes forestiers liés à la génomique

Description

Financé dans le cadre de l’initiative Genomis, le présent projet vise à fournir de l’information sur les pathogènes génomiques dans le but de préciser les ensembles de gènes fondamentaux à intégrer aux outils de détection et de surveillance. Plus particulièrement, nous prévoyons cibler trois des plus importants groupes de pathogènes, soit les rouilles d’arbres, les dothidéomycètes et les oomycètes. Nous comptons aussi  établir et établir de nouveau la séquence de plusieurs génomes, mener des analyses bioinformatiques et isoler les gènes communs et uniques à ces groupes.

Résultats

1. Séquençage de pathogènes génomiques
2. Identification des ensembles de gènes fondamentaux; identification des gènes de pathogénicité de la rouille du peuplier
3. Validation des ensembles de gènes à l’aide d’ensemble d’isolats
4. Détermination de l’origine de l’introduction et des voies de propagation des pathogènes ciblés
5. Collection de pathogènes forestiers, une base de données de séquençage
6. Élaboration de tests biologiques de détection

Partenaires

• University of British Columbia
• FPInnovations
• ACIA
• Génome Canada